截止至3.1版本，遊戲中的首領敵人分別有無相之雷、無相之風、無相之冰、無相之水、無相之火、無相之岩、急凍樹、爆炎樹、掣電樹、北風的王狼，奔狼的領主、純水精靈、古岩龍蜥、魔偶劍鬼、恆常機關陣列、雷音權現、黃金王獸、深海龍蜥之群、遺跡巨蛇、翠翎恐蕈、兆載永劫龍獸以及半永恆統轄矩陣21個。玩家可以在遊戲內的討伐列表內找到它們的所在地。
